Amerikan Doğa Tarihi Müzesi, 19. yüzyılın sonlarına doğru bilimsel bir keşif ve öğrenme merkezi olarak hayata geçti. Theodore Roosevelt Sr. ve Albert S. Bickmore'un öncülüğünde kurulan bu müze, doğanın ve bilimlerin zenginliğini koruma ve sergileme amacını güdüyordu. İlk bina, dönemin mimari özelliklerini yansıtan gotik tarzda inşa edilerek, müzeye özgün bir kimlik kazandırdı. Zamanla artan ilgi ve destek, müzenin fiziksel ve bilimsel açıdan büyümesine olanak tanıdı.

Amerikan Doğa Tarihi Müzesi'nin tarihi, 1869 yılında Theodore Roosevelt Sr. ve bilim insanı Albert S. Bickmore’un girişimleriyle başlamıştır. Müzenin amacı, doğa bilimleri hakkında bilgi toplamak, korumak ve bu bilgiyi halka sunmaktı. Müzenin ilk binası, gotik mimariye sahip olup, müze amacıyla inşa edilen ilk yapıdır. Geçen zamanla artan ilgi ve destek sayesinde, müze genişlemiş ve bugünkü 25 binadan oluşan devasa kompleks haline gelmiştir. Müzenin yapımında, dönemin zengin bağışçıları ve Amerikan Devleti'nin desteği de alınmıştır.