Bulanık Ovası, zengin biyoçeşitliliği ile dikkat çeken bir ekosistemdir. Bu bölge, çeşitli endemik bitki ve hayvan türlerine ev sahipliği yaparak, doğanın korunması açısından büyük önem taşımaktadır. Özelikle göçmen kuşlar ve nadir bitkiler, Bulanık Ovası'nın ekolojik dengesini sağlayan unsurlar arasında yer almaktadır.

Bulanık Ovası'nda bulunan bazı endemik türler şunlardır:

• Telli turna (Grus virgo). Murat Nehri üzerindeki adacıklarda ürer.
• Toy (Otis tarda). Alan, toy için göç döneminde önemli bir bölgedir.
• Mezgeldeğin (Tetrax tetrax). Türkiye'de kesin olarak ürediği üç alandan biridir.
• Büyük akbalıkçıl (Casmerodius albus). Anadolu'da kalan son kolonilerinden birini barındırır.
• Sürmeli kızkuşu (Vanellus gregarius). Bilinen dünya nüfusunun yüzde 25’inden fazlası ekim-kasım aylarında bu alanda konaklar.

Ayrıca, Bulanık ve Malazgirt ovaları, dar yayılışlı beş bitki taksonu için ÖDA (önemli bitki alanı) kriterlerini sağlamaktadır. Bu bitki türlerinden bazıları şunlardır:

• Kaf lalesi (Fritillaria caucasica).
• Yer kekiği (Thymus pulvinatus).
• Keltepe çiğdemi (Crocus keltepensis).
• Muş lalesi (Tulipa aleppensis).
• Damalı lale (Fritillaria aurea).